به منظور از بين بردن عوامل زنده زيان آور از قبيل آفات، قارچها، نماتُدها، باكتريها و غيره لازم است خاك پوششي را ضدّعفوني مي كنيم. در مراكزي كه استفاده از بخار آب گرم وجود دارد معمولاً خاك پوششي به مدت 6 ساعت با بخار آب در دماي 60درجه سانتيگراد پاستوريزه مي شود. (همانند پاستورازيسيون كمپوست در سطح وسيع در سطح محدود مي توان براي ضدّعفوني كردن خاك پوششي از فُرمالين و كلروپيكرين استفاده مي شود. براي اين منظور خاك پوششي را در لايه اي به قطر 15 سانتيمتر روي يك لايه صاف سيماني پخش مي نمايند و سپس فُرمالين 4% روي آن مي پاشند ، مجدداً لايه دوم با همين ضخامت پخش شده و سطح آن را با پلاستيك پوشانده و به همان ترتيب لايه سوم و چهارم نيز فُرمالين پاشي مي گردد و بلافاصله سطح آن با پلاستيك پوشانده مي گردد پس از 2 تا 3 روز گاز فُرمالين كاملاً در لايه هاي خاك نفوذ كرده و آن را استريل مي نمايند. معمولاً براي ضدّعفوني يك متر مكعب خاك پوششي حدود 600 تا 700 ميلي ليتر فُرمالين 37% در 10 ليتر آب نياز مي باشد
خاك پوششي كه به وسيله فرمالين ضدّعفوني مي شود بايد فاقد هرگونه كلوخ و داراي رطوبت مناسب باشد نه زياد خشك و نه داراي رطوبت زيادي كه ذرات بهم بچسبند
در زمان پاستوريزه شدن درجه حرارت خاك پوششي بايد بين 18 تا 24 رجه سانتيگراد باشد و پس از اتمام عمل استريل خاك بايد كاملاً تهويه شود تا هيچ گونه اثري از گاز فرمالين در آن ديده نشود
عملي ** خاك پوششي آماده پرورش قارچ جهت مصرف بايد رطوبت كافي داشته باشد زيرا رطوبت زياد در پخش يكنواخت خاك در سطح بستر ايجاد اشكال مي نمايد و كمبود رطوبت باعث بروز مشكل در پنجه دواني و نفوذ قارچ در خاك پوششي مي شود، چنانچه رطوبت خاك كم باشد با آب پاشي روي خاك رطوبت را به حد مطلوب مي رساند
براي اندازه گيري مقدار رطوبت كافي است مقداري خاك را بين دو انگشت شصت و سوّابه فشار داد، چنانچه خاك در اثر فشار دو انگشت به هم چسبيد ولي هيچ گونه آبي از آن خارج نشد رطوبت مناسب است
